O mangá segue Iori Shijima, um estudante do ensino médio normal abençoado com uma vida bem comum. Ele tem uma bela amiga de infância, muitos amigos em que pode confiar, e uma mãe simpática e bonita. Além disso, suas notas são boas e ele tem um sólido planejamento para o seu futuro. No entanto, um dia "seres transcendentes" chamados ?TRAIL aparecem na Terra, e o cotidiano de Iori desmorona quando ele aprende sobre os segredos do outro mundo e o significado de sua própria existência.